学院坚持以科技创新带动学科及学院发展，以国家重点实验室培育基地为依托，以科技创新为龙头，围绕学院自身特色，凝练学科方向，打造科研团队，积极开展科技创新活动。近年来，学院承担了国家重大基础研究前期专项1项，国家自然科学基金2项，农业部“948项目”2项，科技部农业科技成果转化重点项目1项，教育部项目2项，国家星火计划2项，省十五二期重点攻关项目2项。另外，在省级自然科学基金课题立项中获得丰收。科研经费累计达800万元。与地方政府及企业的横向合作不断加强。三年来，我院获省科学技术成果二等奖1项、三等奖2项，国家教育部霍英东教育基金青年教师奖1项，省高校科技成果三等奖1项，获得国家发明专利1项，申报国家发明专利2项，校教学成果奖多项。主编教材5本，出版专著10部，发表论文近200篇，其中有12篇被SCI收录，国家重点期刊100余篇。
    注重发挥自身的学科优势，服务地方经济。三年来，学院和黄山市、宁国市、桐城市及天方茶业集团等地方政府、企业建立了合作关系，为地方经济建设和社会发展提供技术和人才支持。学院还通过短训班等形式，为地方培养急需人才。2004年底，学院与安徽省质量技术监督局合作，为我省培训了百余名食品安全监测技术骨干，取得了良好的经济效益和社会效益。
    学院还积极开展对外交流，实施“请进来”和“走出去”相结合的战略，加大对外交流。目前已经和美国、英国、以色列、韩国、台湾等多个国家和地区建立了合作关系，对提高我院、我校在国内外的知名度和影响力，起到了巨大的推动作用。